في مدرسة السلطان، يعيش طلاب المرحلة المتوسطة (الصفوف 7 إلى 9) بيئة تعليمية ديناميكية، حيث يدرسون ضمن أسبوع مكوَّن من 40 حصة دراسية. تستغرق كل حصة 40 دقيقة، ويتنقل الطلاب بين صفوف مخصصة لكل مادة في مجموعات مختلطة من حيث القدرات، باستثناء مادة الرياضيات، حيث يُقسَّم الطلاب حسب مستوى قدراتهم.

*تُدرَّس المواد باللغة العربية وفقًا لإرشادات وزارة التربية والتعليم، في حين تُدرَّس المواد باللغة الإنجليزية وفقًا لمنهج كامبردج الدولي.